首先，保底工资三千前半个月只干三天，工资应按实际出勤天数计算。依据《劳动法》相关规定，月工资计算方式为：月工资÷21.75×实际出勤天数。若未按时支付，可能影响员工权益，产生劳动纠纷。
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处理此类工资计算问题，常见方式有协商、申请劳动仲裁或提起诉讼。建议先与公司协商，协商不成可申请劳动仲裁，仍不满意可提起诉讼。选择方式时应考虑效率与成本。
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保底工资计算需分情况：1. 正常工作日出勤三天，则工资为：保底工资三千÷21.75×3。2. 若涉及工作日加班，则需额外支付加班费，计算为：保底工资三千÷21.75÷8×加班小时数×1.5倍。3. 双休日或法定节假日加班，加班费分别按2倍或3倍计算。